南宋建炎年间，少主即位，国师专权。是时镇世封印被解，各路妖魔纵横世间，遂令杭州城人心惶惶。适值此时，玄光寺的不通和尚（郑恺 饰）和女降魔师菁菁（张雨绮 饰）在一次降魔行动中相遇。一千年前，不通和菁菁是

烽烟四起，烟沙弥漫，仙魔两族相对而立，杀意冲天。 两族对战，死伤无数，圣母梵天以己身为祭，封印魔族，终止了一切。仙族虽胜却几近覆灭，昆仑掌门玉清子也为救小弟子而死，惨胜之后，三界恢复平静，两门以休养生

《蜀山降魔传2》讲述了叛离峨眉的云居雁夜袭峨眉大开杀戒，并抢夺了上古灵珠。昆仑得知峨眉惨况后，昆仑长老断言云居雁想集齐四颗灵石一统三界。掌门萧何只有找到昆仑师叔祖逍遥子，并先于云居雁得到魔龙窟守护的灵

昔日上古神兽麒麟锻造了轩辕、承影等七把降魔剑，并点化人间七位修行者成为七剑传人。与此同时长寿城一条修行了千年的蛇妖，为增长修为，残害生灵。七剑传人秉承着守护人间太平职责与蛇妖在黑魔崖上大战，将其封印。